Zotero es la mejor opción para la mayoría de estudiantes e investigadores en 2026, porque es gratis, de código abierto y funciona con Word, LibreOffice y Google Docs. Mendeley es la elección más sencilla si tu universidad ya utiliza herramientas de Elsevier. EndNote tiene sentido cuando tu institución lo licencia o cuando tu laboratorio ya tiene bibliotecas de EndNote. Esta comparación de Zotero vs Mendeley vs EndNote explica a quién le conviene cada uno, cómo mover referencias entre ellos y las tareas que ninguno de los dos cubre.
Si solo necesitas una respuesta rápida, usa la tabla de abajo y ve a la sección que se ajuste a tu situación.
| Tu situación | Mejor opción | Por qué |
|---|---|---|
| Estudiante con presupuesto ajustado | Zotero | El software es gratuito y la cuenta gratuita ofrece 300 MB de almacenamiento |
| Compartición de una biblioteca en grupo de laboratorio | Zotero o EndNote | Zotero no tiene límite de miembros del grupo y EndNote vende licencias para equipos mediante ventas |
| Revisión sistemática | EndNote o Zotero | Zotero importa los formatos que exportan las bases de datos, como RIS y MEDLINE/nbib |
| Usuario de LaTeX y BibTeX | Zotero | Importa y exporta BibTeX y BibLaTeX |
| Tu institución tiene licencia de EndNote | EndNote | Lo obtienes a través de la biblioteca y tus colegas también lo usan |
| Ya trabajas con herramientas de Elsevier | Mendeley | Las cuentas gratuitas obtienen 2 GB, y el complemento para Word se llama Mendeley Cite |
¿Qué gestor de referencias deberías elegir?
Elige Zotero si no tienes otras limitaciones, Mendeley si tu departamento ya lo utiliza, y EndNote si tu institución lo paga. Un gestor de referencias cumple tres funciones. Guarda las fuentes mientras investigas, mantiene una biblioteca con búsqueda y genera citas en el texto y una lista de referencias dentro de tu documento. Las tres herramientas cumplen esas funciones. Las diferencias están en el coste, en lo bien que comparten y en la comodidad del complemento de Word en una tesis larga.
Cambiar más adelante es posible, porque las tres exportan archivos estándar. Aun así, cambiar de herramienta a mitad de una tesis es una tarea, así que elige una antes de escribir el capítulo uno.
Qué es cada herramienta
Zotero es una herramienta gratuita de código abierto, desarrollada por una organización sin fines de lucro. Su página de descargas lista Zotero 10 para macOS, Windows, Linux, iOS y Android. Guarda fuentes desde tu navegador, las organiza en colecciones con etiquetas y búsquedas guardadas, y crea citas en Word, LibreOffice y Google Docs.
Mendeley es propiedad de Elsevier, que lo adquirió en 2013. Tiene una biblioteca web, una aplicación de escritorio llamada Mendeley Reference Manager y un complemento para Word llamado Mendeley Cite. El sitio de Mendeley indica que las cuentas gratuitas incluyen 2 GB de almacenamiento.
EndNote está hecho por Clarivate y es software de pago. El producto que Clarivate promociona ahora es EndNote 2025. También vende EndNote Web, que la página del proveedor describe como una forma de gestionar y sincronizar tu investigación desde cualquier navegador.
Zotero vs Mendeley vs EndNote de un vistazo
Zotero es lo más barato de usar, Mendeley es lo más fácil de empezar con un correo universitario y EndNote es el que con más frecuencia proporciona una institución. La tabla resume lo que dicen las propias páginas de los proveedores.
| Zotero | Mendeley | EndNote | |
|---|---|---|---|
| Creador | Organización sin fines de lucro, código abierto | Elsevier | Clarivate |
| Coste del software | Gratis | Cuenta gratuita | Licencia de pago, con licencia para estudiantes disponible |
| Almacenamiento gratuito | 300 MB | 2 GB | Se anuncia almacenamiento ilimitado para EndNote 2025 |
| Word | Complemento incluido | Complemento Mendeley Cite | Complemento para citar mientras escribes |
| Bibliotecas compartidas | Grupos sin límite de miembros | Grupos compartidos | Opciones para equipos y empresa mediante ventas |
Zotero también tiene un complemento para Google Docs y un conector de navegador para Chrome, Firefox, Edge y Safari, y Mendeley tiene un Web Importer para guardar referencias desde el navegador.
Zotero en 2026
Zotero se adapta a la mayoría de las personas que pagan sus propias herramientas. El software no cuesta nada, no hay bloqueos de funciones y puedes usarlo en cualquier sistema operativo común. El único dinero implicado es el almacenamiento opcional.
La cuenta gratuita ofrece 300 MB para archivos sincronizados. Los planes de pago, con precios en US$ en la página de almacenamiento de Zotero el 20 de octubre de 2026, están en la tabla a continuación.
| Almacenamiento | Precio por año |
|---|---|
| 300 MB | Gratis |
| 2 GB | US$20 |
| 6 GB | US$60 |
| Ilimitado | US$120 |
Tus referencias en sí se sincronizan sin usar ese almacenamiento. Solo los archivos adjuntos, como los PDFs, cuentan para el límite. Muchos estudiantes guardan sus PDFs en una carpeta en su propio equipo o en una unidad en la nube y nunca compran almacenamiento.
Citar en Word, LibreOffice y Google Docs
Zotero tiene complementos para Microsoft Word, LibreOffice y Google Docs. La página de soporte de Zotero indica que se instalan automáticamente para cada procesador de textos compatible en tu ordenador la primera vez que inicias Zotero. El complemento de Google Docs tiene su propia guía de configuración en el sitio de Zotero.
Zotero ofrece compatibilidad con más de 9.000 estilos de citación. Esto cubre APA, MLA, Chicago, Harvard, IEEE y Vancouver, además de una larga lista de estilos específicos de revistas. Si tu revista tiene su propio estilo editorial, hay muchas probabilidades de que ya esté en la lista.
Lectura y anotación de PDFs
Zotero incluye un lector de PDFs integrado con resaltados, subrayados y notas. Puedes incorporar anotaciones a una nota arrastrándolas o con el botón Agregar a la nota, y cada anotación conserva un enlace de vuelta a la página del PDF. Si abres un PDF en un lector externo, las anotaciones realizadas en el lector de Zotero se mantienen en la base de datos de Zotero a menos que exportes un PDF con anotaciones incrustadas.
Grupos y compartición
Los grupos de Zotero existen en tres tipos. Los grupos privados solo son visibles para los miembros. Los grupos públicos con membresía cerrada requieren una invitación o una solicitud aprobada. Los grupos públicos con membresía abierta permiten que se una cualquier persona y no pueden almacenar archivos.
La página de grupos de Zotero indica que no hay límite sobre cuántos miembros pueden unirse a tus grupos. Los archivos del grupo usan la cuenta de almacenamiento del propietario del grupo, así que el plan de una persona cubre los archivos del laboratorio. Los elementos que arrastras a un grupo se convierten en una copia, de modo que los cambios no vuelven a tu biblioteca personal a menos que arrastres el elemento de regreso.
Mendeley en 2026
Mendeley te conviene si tu universidad o laboratorio ya utiliza productos de Elsevier, o si quieres una cuenta gratuita con 2 GB de almacenamiento y una biblioteca web sencilla. En el sitio de Mendeley se enumeran la importación de PDFs, de forma individual o por carpeta, y un Web Importer para capturas desde el navegador. También muestra Watched Folders, que importan cualquier PDF que se suelte en una carpeta de escritorio seleccionada, y Shared Groups donde los colaboradores añaden referencias y anotan PDFs.
Mendeley Desktop, gestor de referencias y Cite
Mendeley ha tenido tres nombres para su software, y eso confunde a la gente. Mendeley Desktop era la aplicación anterior. Según Wikipedia, Elsevier dejó de distribuir Mendeley Desktop en septiembre de 2022 y pasó al nuevo Mendeley Reference Manager. En 2024 planeó dejar de permitir inicios de sesión en Desktop. En julio de 2025, tras recibir comentarios de los clientes, revirtió ese plan y dijo que mantendría Desktop y seguiría ofreciendo soporte esencial.
Mendeley Cite es el complemento de Word que venía con Reference Manager en mayo de 2019. Funciona por sí solo, así que no hace falta que tengas Reference Manager abierto para citar en un documento. También funciona con Word en la web. Para un proyecto nuevo, usa Mendeley Reference Manager con Mendeley Cite. Usar solo Desktop tiene sentido si ya tienes una biblioteca existente y una razón para seguir ahí.
Mendeley y Google Docs
Zotero tiene un complemento para Google Docs, así que si escribes en Google Docs, Zotero es la opción más fácil.
EndNote en 2026
EndNote te conviene si tu universidad lo incluye, porque entonces no te cuesta nada y tu supervisor y tus colegas probablemente también lo usan. EndNote 2025 es el producto actual en el sitio de Clarivate, y allí se indica un complemento de Cite While You Write para Word. Clarivate también vende EndNote Web, que sincroniza tu biblioteca en un navegador.
Precio, estudiantes y grupos
EndNote es un software de pago, y el importe depende de si compras una primera licencia, si actualizas o si te corresponde una licencia de estudiante. La página del proveedor enlaza con una opción de licencia para estudiantes. Para un grupo, ya sea un laboratorio pequeño o toda una institución, Clarivate dice que te pongas en contacto con su equipo de ventas para precios especiales. Aquí dejamos fuera las cifras exactas porque Clarivate las cambia a menudo y muestra precios de oferta en su página de compra; mira el precio actual allí antes de decidir.
Si tu biblioteca ofrece EndNote, revisa qué versión y qué configuración de compartición ofrece antes de instalar. Las licencias por sitio son distintas de las licencias individuales, y algunas incluyen límites sobre cuántas personas pueden compartir una biblioteca.
Almacenamiento
La página de EndNote anuncia almacenamiento ilimitado y pide a los usuarios que actualicen para que el almacenamiento ilimitado no caduque. Pregunta a tu biblioteca si eso aplica a tu licencia.
Compatibilidad con estilos de citación
Las tres herramientas cubren los estilos principales, y la diferencia real es cuántos estilos poco comunes puedes conseguir. Zotero afirma que admite más de 9.000. La página de EndNote describe definiciones de estilos actualizadas continuamente sin dar un número. No tenemos un recuento de estilos para Mendeley a partir de las páginas del proveedor.
Elige tu estilo antes de empezar, porque cambiarlo más tarde es fácil solo si los datos de tu biblioteca están limpios. Los años que faltan, los tipos de ítem incorrectos y los nombres de autor escritos en el orden equivocado son las razones habituales por las que un estilo se ve mal. Nuestra guía de Guía de citación APA 7 para la escritura académica, Guía de citación MLA 9 para la escritura académica, Guía de citación Chicago 17 para la redacción académica, Guía de citación estilo Harvard para la escritura académica, Guía de citación IEEE para artículos de ingeniería e informática y Guía de citas Vancouver para artículos de investigación médica muestra cómo debería verse la salida, para que puedas detectar una entrada defectuosa rápidamente. Si no puedes decidir un estilo, APA vs MLA vs Chicago vs IEEE explica qué campos utiliza cada uno.
Revisa tus citas antes de enviar
Revisa tu manuscrito en ProofreaderPro.ai y, luego, comprueba que cada cita tenga una referencia correspondiente.
Probar el corrector de IAImportar y exportar entre herramientas
Las tres pueden mover referencias mediante archivos estándar, así que nunca quedas bloqueado. Zotero importa RIS, BibTeX, BibLaTeX, CSL JSON, MODS, EndNote XML, Citavi XML, PubMed XML, Web of Science Tagged y muchos más. La página de importación de Zotero describe EndNote XML como el mejor formato para exportar desde EndNote.
Un traslado típico de EndNote a Zotero es así.
- Exporta tu biblioteca de EndNote como EndNote XML.
- En Zotero, elige Archivo, luego Importar y luego un archivo.
- Comprueba el tipo de ítems y los autores en un ejemplo, porque las bibliotecas convertidas a menudo necesitan limpieza.
Zotero tiene una página de Moving to Zotero independiente para usuarios de Mendeley. Para pasar de Zotero a otra herramienta, exporta el archivo RIS o BibTeX e impórtalo.
Revisar el resultado después de una migración
Las bibliotecas importadas a menudo tienen duplicados, campos faltantes y letras mayúsculas en los lugares incorrectos. Abre diez o veinte entradas y compáralas con la fuente antes de empezar a citar. Nuestro convertidor de formato de referencias puede ayudarte cuando tienes una lista de referencias en un estilo y necesitas otro. El Generador de BibTeX es útil cuando necesitas una entrada BibTeX limpia sin tener que abrir tu gestor.
Elegir según la situación
Tu situación decide más que cualquier lista de funciones. Estos son los casos más comunes.
Un estudiante con presupuesto ajustado
Zotero. No cuesta nada, los complementos de Word y Google Docs funcionan bien para ensayos y tesis, y 300 MB es suficiente para una biblioteca de referencias con pocos PDF. Si tu universidad te proporciona EndNote sin coste, aun así puedes elegir Zotero cuando quieras conservar tu biblioteca al graduarte y cuando finalice tu licencia.
Un grupo de laboratorio
Zotero o EndNote. Las bibliotecas de Zotero no tienen límite de miembros y el plan de almacenamiento del propietario del grupo cubre los archivos, así que un laboratorio de diez solo paga como máximo un plan. EndNote se adapta a un laboratorio cuya institución haya comprado licencias para equipos. Los grupos compartidos de Mendeley también funcionan, y sus 2 GB gratuitos encajan bien para un proyecto pequeño.
Pon de acuerdo en una sola herramienta para todo el laboratorio. Una biblioteca compartida solo funciona cuando todos citan desde la misma, y usar herramientas mixtas lleva a entradas copiadas que se van desalineando.
Una revisión sistemática
Usa la herramienta que el equipo ya conoce, y define primero tres cosas: cómo importas exportaciones de bases de datos, cómo eliminas duplicados y quién tiene permiso para editar la biblioteca compartida. Zotero importa los archivos que exporta una base de datos, incluidos los etiquetados como RIS, MEDLINE/nbib y Web of Science. Para las etapas de cribado y extracción, nuestras guías sobre herramientas de IA para revisiones sistemáticas y una revisión compatible con PRISMA cubren lo que la IA puede y no puede hacer.
Un usuario de LaTeX o BibTeX
Zotero. Importa BibTeX y BibLaTeX, así que puedes llevar un archivo .bib existente a tu biblioteca. Si escribes en Overleaf, nuestra guía sobre corregir un artículo de LaTeX en Overleaf muestra cómo editar el texto sin romper tus comandos de citación.
Una institución que licencia EndNote
EndNote. Cuando la biblioteca paga y se imparten capacitaciones, obtienes soporte, y tus colegas podrán leer los archivos de tu biblioteca sin problemas. Tu acceso puede terminar cuando termine tu afiliación, así que exporta tu biblioteca como archivo una vez por trimestre como copia de seguridad.
Lo que ningún gestor de referencias hace
Ninguno de los tres comprueba si tu documento es correcto. Un gestor de referencias inserta lo que hay en tu biblioteca. No decide si una entrada es real, si una cita aparece en tu texto, o si tu lista de referencias tiene una entrada adicional.
Son las brechas que permanecen después de terminar con Zotero, Mendeley o EndNote.
| Problema | Gestor de referencias | Qué ayuda |
|---|---|---|
| Citas en el texto escritas con el estilo incorrecto | Solo formatea las citas que inserta | corrector de citas en el texto |
| Una referencia que inventa una herramienta de IA | Guarda todo lo que escribes o importas | comprobador de citas con IA |
| Referencias en texto sin formato pegadas desde un chatbot | Requiere entrada manual | Generador de citas |
| Gramática y estilo en las oraciones que rodean las citas | No es su trabajo | Corrector de ProofreaderPro.ai |
Citas que no coinciden
Las revistas rechazan trabajos por referencias huérfanas y citas que faltan. Si citas con un complemento, las discrepancias son raras, pero aun así ocurren cuando pegas texto de otro documento o rompes los códigos de campo del complemento. Revisa a mano antes de enviar: recorre la lista de referencias y busca en el texto a cada autor y año. El arreglador de citas en el texto gratuito ayuda con un problema distinto: citas escritas con el estilo equivocado y las convierte a APA 7, MLA 9, Chicago autor-fecha o Harvard.
Referencias inventadas por herramientas de IA
Las herramientas de chat con IA pueden generar referencias que se ven correctas y no existen. Un gestor de referencias las guardará encantado si las escribes. Antes de enviar, pasa tu lista por el verificador de citas de IA y sigue los pasos de nuestra auditoría de citas inventadas.
Dónde encaja ProofreaderPro.ai
ProofreaderPro.ai no reemplaza un gestor de referencias, y tampoco está pensado para hacerlo. Conservas Zotero, Mendeley o EndNote para tu biblioteca y tu complemento. Nosotros nos encargamos de la redacción alrededor de eso. El corrector mejora la gramática y el estilo académico, y las herramientas de citas formatean una sola fuente en el estilo elegido. El humanizer de IA preserva las citas cuando reescribe texto asistido por IA. Consulta el humanizer que preserva citas académicas y por qué las herramientas de parafraseo dañan las citas para más detalles.
Un flujo de trabajo sencillo que funciona con cualquiera de los tres gestores:
- Reúne fuentes en tu gestor mientras lees.
- Escribe y cita con el complemento.
- Revisa el borrador en ProofreaderPro.ai.
- Verifica las citas y la lista de referencias entre sí.
- Ejecuta el verificador de citas de IA en todo lo que provenga de un chatbot.
Si estás escribiendo una tesis completa, herramientas de IA para escribir una tesis indica dónde encaja cada etapa.
Mendeley Cite no funciona en Word
La causa más común de que Mendeley Cite muestre un panel en blanco en Word es una configuración de seguridad que impide que se ejecute su JavaScript. El artículo de soporte de Elsevier indica que, en Windows, debes configurar la zona de seguridad de Internet en Medium-High o inferior, y consultar con el administrador del sistema si no puedes cambiarlo. En Mac, el JavaScript debe estar habilitado en Safari.
Otros problemas tienen otras causas. El soporte de Elsevier también señala que, para documentos que funcionaban antes, las imágenes grandes o superpuestas pueden impedir que se carguen las referencias. En ese caso, desagrupa las imágenes superpuestas y comprímelas en Word. Si tu cuenta de Office pertenece a una universidad, un administrador pudo haber bloqueado los complementos y, entonces, necesitas que tu equipo de TI permita Mendeley Cite.
Mendeley y Claude
Para usar Claude con tu biblioteca de Mendeley, exporta las referencias que necesitas como RIS o BibTeX y súbelas o pégalas en un chat. Luego, Claude puede ayudarte a resumir, agrupar o comparar esas fuentes. Algunos desarrolladores independientes también publican herramientas comunitarias que conectan Claude con una biblioteca de Mendeley. No las crea Mendeley ni Elsevier, así que revisa qué acceso solicitan antes de conectar tu cuenta.
Independientemente de la forma en que trabajes, mantén el gestor de referencias como el registro de tus fuentes. Si lo haces, revisa cada referencia que devuelva el chatbot con tu biblioteca, porque las herramientas de IA pueden alterar autores, años y títulos.
Preguntas frecuentes
¿Qué es mejor, Zotero, Mendeley o EndNote?
Zotero es la mejor opción para la mayoría de las personas porque es gratuito, de código abierto y funciona con Word, LibreOffice y Google Docs. Mendeley encaja con quienes ya usan herramientas de Elsevier, y EndNote encaja con quienes su institución lo licencia. La mejor herramienta es la que usan tus coautores.
¿Zotero es gratuito?
Sí. Zotero dice que es una herramienta gratuita desarrollada por una organización sin ánimo de lucro, y la cuenta gratuita incluye 300 MB de almacenamiento. Los planes de almacenamiento de pago comienzan en US$20 al año por 2 GB, según la página de almacenamiento de Zotero del 20 de octubre de 2026.
¿Mendeley sigue recibiendo soporte?
Sí. Elsevier dejó de distribuir Mendeley Desktop en septiembre de 2022 y trasladó a los usuarios a Mendeley Reference Manager. En julio de 2025 dijo que mantendría Desktop y seguiría ofreciendo soporte esencial, según Wikipedia. Mendeley Cite es el complemento actual de Word.
¿Por qué Mendeley Cite no funciona en Word?
Por lo general, aparece un panel en blanco debido a configuraciones de seguridad que bloquean JavaScript, tal como se describe arriba. Elsevier indica configurar la zona de seguridad de Internet de Windows en Medium-High o inferior y habilitar JavaScript en Safari en un Mac. Si tu cuenta de Word la administra una universidad, pide a tu equipo de TI que permita el complemento.
¿Puedo mover mi biblioteca de EndNote a Zotero?
Sí. Exporta tu biblioteca de EndNote como EndNote XML y, luego, importa ese archivo en Zotero con Archivo, Importar, Un archivo. La página de importación de Zotero denomina EndNote XML el mejor formato para exportar desde EndNote. Revisa una muestra de las entradas después para los tipos de ítems y los nombres de los autores.
¿Zotero funciona con Google Docs?
Sí. La página de compatibilidad de Zotero enumera Microsoft Word, LibreOffice y Google Docs como herramientas compatibles, y el complemento de Google Docs tiene su propia guía en el sitio de Zotero.
¿Los gestores de referencias verifican que mis citas coincidan con mi lista de referencias?
No. Insertan entradas de tu biblioteca y las formatean. Para detectar discrepancias, busca en tu texto cada autor y cada año en la lista de referencias. El corrector de citas en el texto gratuito corrige las citas escritas con el estilo incorrecto.
¿Un gestor de referencias puede detectar referencias que un AI haya inventado?
No. Un gestor almacena lo que importas o escribes, sea real o no. Usa el verificador de citas de AI antes de enviar, y sigue las comprobaciones del informe de auditoría de citas alucinadas.
¿Mendeley funciona con Claude?
Sí, mediante una biblioteca exportada. Exporta las referencias como RIS o BibTeX y entrega el archivo a Claude, y algunas herramientas comunitarias independientes conectan Claude con una biblioteca de Mendeley. Revisa cada referencia que escriba Claude con tu biblioteca.
Revisa tu artículo para mejorar la gramática, la claridad y el estilo académico, y luego verifica tus citas antes de enviarlo.

Dana es creadora de contenidos en ProofreaderPro, donde dirige las operaciones diarias de redacción y blogs. Ella escribe artículos sobre cómo funciona la plataforma de edición en línea y maneja los mensajes de los clientes todos los días, con una puntuación de satisfacción de cinco estrellas como prueba.